Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf8Q99PV0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms