Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms