Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930550L24RikQ99PA7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms