Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hdac9Q99N13 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Hdac9Q99N13 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdac9Q99N13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdac9Q99N13 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdac9Q99N13 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdac9Q99N13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdac9Q99N13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hdac9Q99N13 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdac9Q99N13 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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