Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms