Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms