Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms