Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms