Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms