Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pacsin3Q99JB8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms