Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ddb2Q99J79 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ddb2Q99J79 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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