Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf144aQ925F3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf144aQ925F3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf144aQ925F3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf144aQ925F3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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