Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrif1Q923B3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms