Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms