Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms