Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacng8Q8VHW2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacng8Q8VHW2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms