Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms