Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms