Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8VDP2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms