Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn4Q8VCH8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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