Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RfxapQ8VCG9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RfxapQ8VCG9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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