Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms