Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd3Q8K2C9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms