Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cmc2Q8K199 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cmc2Q8K199 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms