Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc47a1Q8K0H1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc47a1Q8K0H1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms