Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms