Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ep400Q8CHI8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms