Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHB8

Ttll5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll5Q8CHB8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll5Q8CHB8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll5Q8CHB8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms