Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc43a2Q8CGA3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms