Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrif1Q8CDD9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrif1Q8CDD9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms