Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf3Q8BYK6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ythdf3Q8BYK6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms