Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms