Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms