Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms