Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms