Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ClspnQ80YR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClspnQ80YR7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms