Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmcc2Q80W04 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc2Q80W04 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms