Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms