Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dsg1cQ7TSF0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg1cQ7TSF0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg1cQ7TSF0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg1cQ7TSF0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dsg1cQ7TSF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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