Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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