Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx4Q7TNK1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms