Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320.3 ms