Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NinlQ6ZQ12 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms