Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms