Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp49Q6P9L4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms