Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms