Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg2aQ6P4T0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms