Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt39Q6IFX4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms