Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn4Q69Z26 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms