Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms